Navegando por Autor "Ogawa, Guilherme Maerschner"

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    Análise de dados do programa de triagem neonatal de fibrose cística através da quantificação de IRT – Tripsinogênio Imunorreativo utilizando aprendizado de máquina para reduzir falsos positivos
    (2023-03-07) Oliveira, Virgínia Klausner de; Vieira, Lúcia; Sakane, Kumiko Koibuchi; Ogawa, Guilherme Maerschner; Godoy, Carlos Marcelo Gurjão de; Custódio, Paulo Rogério Siqueira; São José dos Campos
    Essa pesquisa trata-se da utilização de florestas aleatórias para criação de uma metodologia para desenvolvimento de um modelo capaz de fazer previsão de casos verdadeiros positivos na triagem neonatal de fibrose cística, utilizando dados sintéticos para treinamento do modelo e variando os parâmetros do modelo para buscar aquele que retorne o melhor poder preditivo, assim tendo uma prova de conceito para utilização dessa metodologia para encontrar um modelo capaz de fazer a previsão de verdadeiros positivos para fibrose cística em um banco de dados real. A fibrose cística é uma doença, que faz parte do programa nacional de triagem neonatal brasileiro que é causada por mutações do gene de Condutância Transmembrana da Fibrose Cística (CFTR, do inglês Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator). Esta doença é caracterizada pela produção de um muco espesso podendo causar problemas respiratórios, gastrointestinais, complicações metabólicas entre outras enfermidades que variam de acordo com as mais de 2000 mutações existentes. Já a floresta aleatória é um algoritmo comum de aprendizado de máquina que consiste em utilizar um banco de dados para treinar um modelo de inúmeras árvores de decisão capazes de criar critérios para tentar explicar um dado alvo baseando-se em atributos, para poder fazer previsões em um novo banco de dados desconhecido utilizando somente os atributos. Esse tipo de tecnologia vem ganhando espaço na área da saúde principalmente na área de diagnóstico por conta de seu alto poder preditivo. A triagem dessa doença faz parte do programa de tiragem neonatal brasileiro através do teste do pezinho, que é feita com a quantificação da tripsina imunorreativa, este exame possui alta incidência de falsos positivos. Se esta prova de conceito for positiva pode-se fornecer atendimento precoce a esses pacientes, aumentando suas expectativas de vida. Para isso, foi utilizado índices gerais (número de pacientes triados e número de exames alterados) de triagens e diagnóstico do laboratório de triagem neonatal APAE (Associação de Pais e Amigos dos Excepcionais) de São Luís do Maranhão, para desenvolver uma metodologia que buscasse sempre a melhor sensibilidade para o modelo. Os resultados obtidos nesta dissertação com dados sintéticos mostram que essa metodologia pode permitir alcançar o objetivo devido a melhora que ela trouxe na sensibilidade do modelo mesmo que utilizando dados sintéticos para o treinamento, o que tende a melhorar quando utilizar dados reais de pacientes, pois a correlação desses dados será maior o que fará com que o modelo tenha melhor ajuste sobre os dados sendo capaz de explica-los com a sensibilidade e precisão superior à obtida com os dados sintéticos.
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    Desenvolvimento de método de detecção múltipla e simultânea de anticorpos da classe IGM contra Toxoplasma Gondii, rubéola e citomegalovírus
    (2022-12-14) Soares, Cristina Pacheco; Ferreira-Strixino, Juliana; Raniero, Leandro José; Ogawa, Guilherme Maerschner; Almeida, Rainara Moreno Sanches de; Silva, Newton Soares da; São José dos Campos
    O diagnóstico sorológico durante a triagem pré e neonatal é de extrema importância na prevenção de doenças. Dentre as doenças infecciosas, as mais comuns são a toxoplasmose, rubéola e citomegalovírus. Os métodos tradicionais de diagnóstico utilizados na triagem neonatal detectam por ensaio um único agente infeccioso. A utilização de métodos de detecção múltipla e simultânea aumenta a produtividade e diminui a quantidade de material utilizado, resultando em um ensaio mais eficiente do ponto de vista técnico, ambiental e econômico. O objetivo do nosso estudo é desenvolver um método de detecção simultânea de anticorpos da classe IgM contra Toxoplasma gondii, rubéola e citomegalovírus. Para isso foram realizados acoplamentos de diferentes antígenos em microesferas magnéticas, seguido de ensaios de desempenho para identificar os melhores parâmetros a serem utilizados, como melhor concentração e tampão. Após definido os acoplamentos, foram realizados ensaios para obtenção dos valores de corte, sensibilidade e especificidade de cada antígeno acoplado. Em seguida, foram realizados ensaios de desempenho para validação analítica dos produtos diagnósticos seguindo as normas na Agência Nacional de Vigilancia sanitaria (ANVISA). Os parâmetros avaliados foram repetibilidade, reprodutibilidade, linearidade, robustez, alta dose, limite mínimo de detecção, especificidade analítica e estabilidade acelerada. Todos os dados obtidos atenderam aos critérios de aceitação da RDC 166/17 para utilização do produto diagnóstico em território nacional. Os ensaios de repetibilidade e reprodutibilidade apresentaram Constante de Variação (CV) menor que 15% entre as replicatas do mesmo operador e operadores distintos. O kit apresentou linearidade em toda a faixa de trabalho com R2 acima de 0.990 e não foi observado efeito de alta dose de anticorpos na diluição de trabalho escolhida. Além disso, o kit não apresentou interferência da matriz com os resultados e foi observado que pequenas e deliberadas alterações no tempo de incubação de cada reagente não afetam de forma significativa nos dados obtidos.
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    Modelo de florestas aleatórias para identificar falsos positivos na triagem de fibrose cística com dados artificiais
    (Grupo MultiAtual Educacional) Custódio, Paulo Rogério Siqueira; Oliveira , Virginia Klausner de; Ogawa, Guilherme Maerschner; Almeida, Rainara Moreno Sanches de
    A Fibrose Cística é uma doença letal que é caracterizada por infecções crônicas no pulmão, insuficiência pancreática e elevados níveis de cloro no suor, essa doença é causada pela mutação no gene do Regulador de Condutância Transmembrana da Fibrose Cística (CFTR), essa doença faz com que o organismo produza secreções espessas e viscosas que obstruem os pulmões, pâncreas e no ducto biliar (RIBEIRO ROSA e colab., 2008). Esta doença faz parte do programa de Triagem Neonatal Brasileiro, sendo triada através da quantificação do Tripsinogênio Imunorreativo (IRT), entretanto essa tripsina apresenta um elevado índice de resultados falsos positivos, isso faz com que seja necessário um outro teste para confirmação do diagnóstico. Sabe-se pela literatura que existem fatores que influenciam na alteração da tripsina como a etnia por exemplo devido a doença ser em sua grande maioria na população caucasiana. Então este trabalho propõe a utilização de técnicas de florestas aleatórias para conseguir detectar a probabilidade de um resultado ser falso positivo analisando as informações
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    Performance of Multiplex Detection Method of IgM Class Antibodies against Toxoplasma gondii, Rubella and Human Cytomegalovirus
    (JSciMed Central) Almeida, Rainara Moreno Sanches de; Ogawa, Guilherme Maerschner; Custódio, Paulo Rogério Siqueira; Sampaio, Maria Alcantara Socorro; Silva, Newton Soares da; Soares, Cristina Pacheco
    Serological diagnosis during neonatal screening is crucial in disease prevention. Among the infectious diseases, the most common are toxoplasmosis, rubella, and cytomegalovirus. Traditional diagnostic methods are used to detect a single infectious agent per test. The use of multiplex detection methods increases productivity and reduces the amount of material used, resulting in a more efficient test from a technical, environmental, and economic point of view. The study’s objective was to evaluate the performance of a new diagnostic method aimed at neonatal screening using the multiplex platform of magnetic microspheres from the company Luminex Corporation. For this, tests were carried out for analytical validation of the diagnostic product developed following the rules of the National Health Surveillance Agency (ANVISA) of Brazil. The parameters evaluated were repeatability, reproducibility, linearity, robustness, high dose, minimum detection limit, and analytical specificity. All data obtained met the acceptance criteria of RDC 166/17 of 2017 for the use of the diagnostic product in the national territory. Repeatability and reproducibility tests showed a CV of less than 15% between replicates of the same operator and different operators. The kit showed linearity throughout the operating range with R2 above 0.990, and no effect of high-efficiency dose was observed in the chosen working dilution. In addition, the kit did not show interference from the matrix with the results, and it was observed that small and deliberate changes in the incubation time of each reagent did not have a significant effect on the data obtained.